Sekcja Rejestracji, Dokumentacji Chorych i Statystyki Medycznej stanowi w Szpitalu ważne ogniwo łączące część medyczną z częścią finansową. Zbiera i oblicza wszystkie wykonania, a więc strukturę i liczbę hospitalizowanych oraz pacjentów ambulatoryjnych. Przygotowuje i przesyła sprawozdania resortowe przewidziane dla szpitali, a także przedstawia Dyrekcji materiały do rozliczeń finansowych z NFZ. Współpracując z sekcją informatyki na bazie wdrożonego systemu komputerowego szpitala wprowadza ułatwienia w funkcjonowaniu całości i dostępie do gromadzonych informacji. Sekcja prowadzi także Archiwum Medyczne Szpitala i spełnia ustawowy obowiązek gromadzenia i przechowywania dokumentacji medycznej, a także jej udostępniania uprawnionym osobom lub instytucjom. Rejestracja poradnictwa ambulatoryjnego, położona na niskim parterze ułatwiającym wejście małym pacjentom, została zaprojektowana w baśniowe motywy przyciągające uwagę dziecka i łagodzące jego obawy przed sytuacją stresową.