Właścicielem majątku nieruchomego (grunty, budynki i budowle) Samodzielnego Publicznego Dziecięcego Szpitala Klinicznego im. L. Zamenhofa AM w Białymstoku jest Uniwersytet Medyczny w Białymstoku.
Szpital użytkuje i zarządza nieruchomościami przekazanymi przez Uniwersytet w nieodpłatne użytkowanie na podstawie Umowy zawartej w dniu 31 grudnia 2002 roku. 

Powierzchnia użytkowa gruntów Szpitala obejmuje obszar 39 695 m².
Powierzchnia użytkowa budynków wynosi  25 809,30 m².

Wartość majątku Szpitala określają:
1. fundusz założycielski,
2. fundusz zakładu,
których łączna wartość na dzień 31.12.2007r. wynosi 49 835 170,18 zł.

Sprawozdanie finansowe jednostki za 2006 rok zostało złożone w Krajowym Rejestrze Sądowym Sądu Rejonowego w dniu 31.05.2007r. oraz zostało opublikowane w Dzienniku Urzędowym Rzeczypospolitej Polskiej „Monitorze Polskim B” nr 1248 poz. 7083 z dnia 22 listopada 2006r.